石材在使用过程中，或多或少都会受到不同程度的污染，问题主要有三方面：一是石材内部的一些物质成份与大气中的物质发生化学反应而形成的；而二是日益严重的空气污染所致；三是由于石材在安装时施工方法不当所造成的。
　　一、锈斑锈斑
　　形成来自于两方面：一是自然反应生成。因为石材内部的物质成份中都含有赤铁矿和硫铁矿，这些铁质矿物接触空气被氧化而生成三氧化二铁（铁锈）后，通过石材的毛细孔渗出；二是因为石材在开采、加工、运输、安装、使用等过程中，不可避免的接触到铁制物品，这些铁质物品的残留沾敷在石材表面，被氧化后形成铁锈污染。预防锈痕的关键是石材在安装前必须采用树脂注入的方法使石材具备防水功能，以防止石材内部的铁质矿物被氧化后渗出石材表面。安装后必须彻底清洗石材，防止石材因外界污染造成锈痕。在施工方法方面尽可能采用干挂方式，尤其是象美国白麻等一类较容易出现锈斑的石材，更应避免使用湿式施工方法，必要时可在安装前做全方位的除锈和防水处理。处理已出现的锈痕，国内外主要的产品是除锈剂，理想的除锈剂应具备两个条件：首先是除锈后的石材料不会再生锈；其次要求除锈剂本身不腐蚀石材，不影响石材表面光泽度。在除锈后，用清水彻底清洗，再用防护剂进行防护，使石材具有防水功能，以防日后其它病变的发生和由于化学腐蚀造成的麻烦。
　　二、湿痕不干
　　形成的主要原因是受湿式施工方法中的水泥沙浆影响所致。因为水泥的成份中含有1%~2%的氢氧化钠.由于其对水份的吸附性很强，在潮湿的大气中当环境温度高于35度，立刻形成具有腐蚀性的碳酸钠溶液。结晶水常因温度的变化而变化，但永远不会匮乏，这就形成了湿痕不干的现象。预防的方法主要是对石材进行防护，使石材料具有防水性，以此阻隔空气中的水份与石材或水泥内部物质的接触，降低其化学反应条件；其次应尽量避免采用水泥施工安装属材；最后还要切实做好填缝工程和排水工程。
　　三、盐类晶化
　　这种现象主要是因属于强碱性的水泥与大气中的酸性溶液反应而成。碳酸钠溶液通过石材的毛孔渗出到石材表面后，立刻与含有碳酸的潮气进行中和反应，生成盐类溶液，溶液中的水份干涸后，就形成盐类晶化。遇水溶解就大面积出现。预防首先要尽可能避免采用湿式施工方法，其次用防护剂使石材具备防水性能。并切实做好填缝工程。
　　四、石灰剥蚀
　　这种现象出自于尚未被碳酸化的石灰溶液渗透到外墙表面，很快和大气中的二氧化碳反应，生成不易水解的碳酸钙，成为一层永久性的被覆层。这种现象主要发生在石材接缝处。
　　五、霜冻破坏
　　此类现象主要是因石材内部的毛细孔和裂痕所吸收的水份遇冷结冰所致。因为液态水结冰后体积膨胀率约在10%左右，这样就对石材内部产生很大的压力而胀裂石材。一些多孔的石材更易发生这类情况。
　　六、苔藓植物的生长
　　现象主要发生在石材内部水份和有机质含量高的部位，它会导致石材变色，降低石材的强度和使用寿命。预防措施首先要做好排水工程避免积水；再加上应用防护剂，使石材具备良好的防水能。对已出现的苔藓应先用工具将其铲除，再用专业的清洗剂清洁，最好将石材做防护处理，防水并改善原有的排水设施。
　　七、化学腐蚀
　　这是由于工业废气家加上汽车排放的废气，使空气中二氧化硫和三氧化硫的含量陡增的原因。溶于水中形成酸性溶液，可轻易地溶石材中的碳酸钙，造成化学腐蚀。预防是施工前做好石材的防水，防止这些有害溶液进入石材。